Vitenskap

En avføringsprøve oppdager 90 prosent av tykktarmskrefttilfeller uten koloskopi

Peter Finch

Verdens nest dødeligste kreftform kan nå oppdages med en avføringsprøve og en algoritme. Forskere ved Universitetet i Genève har utviklet en test som identifiserer 90 prosent av tilfeller av kolorektal kreft — uten koloskopi, uten sedering og uten sykehusbesøk. Metoden fungerer ved å lese skjulte signaler i tarmbakterier med en presisjon som ingen diagnostisk verktøy tidligere hadde oppnådd.

Kolorektal kreft dreper over 900 000 mennesker i året globalt. Oppdaget tidlig overstiger overlevelsesraten 90 prosent. Problemet har alltid vært koloskopien — dyr, ubehagelig og med en forberedelse som krever en hel dag, noe som fører til at millioner av mennesker verden over utsetter screening. Denne forsinkelsen er ofte forskjellen mellom en behandlingsbar diagnose og en terminal.

Tarmbakteriene kartlagt ned til subspeciesnivå

Genève-teamet angrep problemet fra en helt annen vinkel. I stedet for å undersøke tykktarmen direkte kartla de tarmmikrobiomet med et detaljnivå ingen tidligere hadde forsøkt — ned til subspecies for hvert bakteriestamme. Ulike subspecies av den samme bakterien kan ha stikk motsatte effekter: noen fremmer tumorvekst, andre er nøytrale. Tidligere tester som bare analyserte på artsnivå, gikk fullstendig glipp av dette signalet.

En maskinlæringsmodell trent på denne bakteriologiske katalogen på subspeciesnivå leser en standard avføringsprøve og forutsier tilstedeværelsen av kolorektal kreft med 90 prosents nøyaktighet. Koloskopi oppnår 94 prosent. Alle eksisterende ikke-invasive metoder ligger under begge — de beste nåværende alternativene når 70 til 80 prosent.

Klinisk studie forberedes med Genèves universitetssykehus

En klinisk studie i samarbeid med Genèves universitetssykehus forberedes for å fastslå hvilke kreftstadier og lesjonstyper metoden oppdager mest effektivt. Hvis resultatene bekrefter modellens nøyaktighet i ulike populasjoner, kan testen bli et førstelinje screeningverktøy — med koloskopi forbeholdt utelukkende pasienter med positivt resultat. Studien ble publisert i Cell Host & Microbe.

Diskusjon

Det er 0 kommentarer.